由于我国小农户种植与规模化养殖脱节、种养循环不畅，专业化服务组织数量少、规模小、专业化机械化水平低、服务能力弱，再加上种养结合养分平衡管理机制缺乏，有的地方不考虑植物养分需求，过量施用，不仅造成作物减产，同时还带来了环境污染。有的地方矫枉过正，要求粪便肥水经过处理后达到灌溉水标准或者排放标准再用于农田，不仅增加成本还失去养分价值。粪便还田难题还没有完全解决，全国70%以上农业园区为单一种植业或单一养殖业，粪肥还田“最后一公里”问题仍待解决。

　　畜禽粪污处理与资源化利用可以采用生态养殖模式，就地消纳畜禽粪污。利用生态优势发展林下养殖、田间养殖等家庭农场为单位的生态立体养殖模式，规模牛场产生的粪便直接用于蚯蚓养殖或经干湿分离用于奶牛卧床垫料，场内循环利用，再生利用就地消化畜禽粪污。

　　畜禽粪污利用信息化监管平台的建设可以帮助粪肥利用种养结合政策落实。监管平台的监测对象包括规模养殖场、第三方机构、施用田块3个部分。监测环节包括饲料投入、贮存处理、粪污运输、还田利用等主要环节。监测内容包括所有环节中的氮磷钾养分、重金属、抗生素等在粪污、空气、土壤和水体中的含量。各地相关部门督促规模养殖场、专业机构和种植业农户做好粪污收集、处理、利用全过程信息记录，逐步实现粪肥农田利用的可监测、可报告和可核证。

　　随着公共信息平台的开发和信息整合技术的发展，信息化技术已开始普遍应用于畜牧业监管管理中，而上海奇博自动化科技有限公司投入科技人员专门专为政府主管部门的智慧畜牧监管系列产品、针对大中小养殖场养殖集团合作社的智慧养殖管理系列产品，应用于畜牧业监管管理各环节，将彻底改变传统的管理模式，极大地提高管理监管运行效率。